新疆是我国重要的边疆地区，资源丰富、民族众多、文化发达。近代以来成为列强侵略扩张、争夺霸权的重要地区，从那时起，新疆边疆问题就成为许多有识之士关注研究的对象，对种种歪曲史实、制造混乱、甚至图谋分裂中国新疆的种种谬论进行了批驳和回击。

　　20世纪以来，由于各种出土文物，文献资料的新发现，新疆史地研究更成为一门国际“显学”。我国不仅建立了许多相应的研究机构，而且形成了多种学科的专业研究队伍，研究内容几乎涵盖了有关新疆历史地理的所有领域，取得了不少研究成绩。进一步加强对新疆历史与现状问题的整体、系统性的思考，加强前瞻、战略性的研究，诸如对新疆各民族的历史、各民族的关系史、历史上新疆地方政权与中原中央王朝的关系等问题，还需要进行更为系统、深入和更为理论化的研究；在当前改革开放新形势下，新疆稳定与发展现状研究所面临的许多新问题和新挑战，这些都需要学者们共同努力，深化研究，合作攻关。

　　改革开放以来，新疆周边的国际环境发生了很大变化，苏联解体，哈萨克斯坦、吉尔吉斯斯坦、乌兹别克斯坦、塔吉克斯坦、土库曼斯坦中亚五国相继独立，“9·11”事件后，美国等西方国家加紧了对阿富汗、巴基斯坦、印度等国的渗透，中亚、南亚日益成为世界瞩目的热点地区。新疆地处中亚地区，与上述国家领土相接，在宗教、文化、民族等方面与上述国家有千丝万缕的联系。改革开放以来，新疆区域在稳定与发展方面出现了一些复杂、多变的局面，面对这种形势，加强新疆历史与现状的研究，已成为学者们日益关注的研究课题。

　　2004年5月，由中国社会科学院中国边疆史地研究中心牵头申请了国家社科基金特别项目“新疆历史与现状综合研究”（以下简称“新疆项目”），并于2005年正式启动。“新疆项目”的重要任务，就是在评估已往新疆研究、总结前人成果的基础上，将新疆历史与现状研究提升到一个新的水平；同时，发挥专家学者的咨询作用，为新疆的改革开放提供科学的建议与参考。

　　“新疆项目”共分为基础研究和应用研究两大部分；涵盖研究类、档案文献整理、重要外文成果翻译、社会发展调查、普及读物等5大系列；此外，还在将图书资料、网络数据库建设等方面做专项投入。

　　“新疆项目”是一项跨学科、跨地域、跨部门的大工程，仅依靠中国社会科学院的力量是不可能高质量高水平地完成的。因此，该项目着眼于协调国内学术前沿的研究力量，尤其是新疆区域的研究力量。